La gestion de l'OSFAC est composé de trois principaux organes administratifs: l'Assemblée générale, le Conseil d'Administration et la Direction Générale basée à Kinshasa, République Démocratique du Congo. Dans tous les pays du bassin du Congo, OSFAC est représenté par des organismes nationaux (points focaux) qui coordonnent les activités dans l'ensemble du bassin du Congo.
